I am Worried that my Childhood Friend is too Cute! (Ore no Tomodachi ga Kawaisugite Komaru! )

Amano, yang kembali ke kota tempat tinggalnya sewaktu kecil untuk pertama kalinya dalam 10 tahun, bertemu dengan teman masa kecilnya, Yukio Sawatari, pada hari pertama pindah sekolah—ketika Yukio (yang dulunya seorang teman laki-laki) telah berubah menjadi perempuan. Meskipun Yukio merasa senang bisa bertemu kembali, ia tidak dapat menyembunyikan rasa canggungnya karena secara mendadak berubah menjadi seorang gadis.

Yukio mengidap penyakit langka yang dialami oleh 100.000 orang lainnya, di mana seseorang tiba-tiba berubah menjadi perempuan, sebuah fenomena yang disebut "spontaneous isomerism metamorphosis". Teman masa kecil ♂ yang kini menjadi perempuan ini sungguh menggemaskan, namun akankah hal ini menimbulkan masalah?